内容讲述古代有一位皇帝头上长了一个肉瘤，叫来一位民医和二位御医给其看病。谁能治好皇帝的病将得到重赏。三位医生诊视之后，一位民医主张用针灸的方法可以治疗，一位御医认为吃些补药就可痊愈，另一位御医说这根本就不是病，皇帝是真龙天子，头上的肉瘤是龙珠是神龙的象征。皇帝认为两个御医说得对，重赏了两个御医，把民医哄了出去。皇帝吃了人参、鹿茸等很多的补药，过了数天肉瘤越长越大把头抱了起来。皇帝慌忙把三位医生又叫来诊治。一位御医不知如是好，另一位御医认为这还不是病，皇帝神仙下凡，头上的肉瘤变大，犹如老寿的前额是吉祥、长寿的象征。民医力谏，此乃病情加重，必须手术把肿瘤割除，才能保全性命。皇帝一听大怒认为民医是刺客，不由争辩把民医推出杀了，又重赏了两位御医。没过几天皇帝病发身亡了。
动画片《医生与皇帝》荣获国家首界“华表奖”最佳美术片大奖。这也是长春电影制片厂第一次赢得美术片国家大奖。